Fasli Jalal adalah Wakil Menteri Pendidikan untuk periode 2010 hingga 2011. Setelah itu ia ditunjuk untuk memimpin Badan Keluarga Berencana Nasional (BKKBN) pada tahun 2013. Ia juga menulis dan menyunting beberapa buku dan artikel ilmiah. Salah satu karyanya adalah Strategi Pemberantasan Kemiskinan Berbasis Peningkatan Kapasitas Keluarga Miskin.
Fasli kini terlibat dan menjadi salah satu inisiator Kawal Pendidikan, sebuah gerakan sipil yang berfokus pada peningkatan kualitas pendidikan di Indonesia. Beliau telah menerima Work of Excellence Award dari Bank Dunia pada tahun 2011, serta Satyalancana Wira Karya dan Satyalancana Wira Setia Award dari pemerintah Indonesia pada tahun 1996 dan 1997.